297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0691 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
200 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  79.4 
 
 
211 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 
209 aa  247  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  65.15 
 
 
202 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  62.56 
 
 
212 aa  235  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  64.97 
 
 
217 aa  235  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.72 
 
 
212 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 
208 aa  228  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 
209 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  60.91 
 
 
215 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 
211 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 
230 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  62.96 
 
 
218 aa  220  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  55.78 
 
 
208 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  60.2 
 
 
258 aa  216  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  57.71 
 
 
211 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 
226 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  59 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  55.28 
 
 
214 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 
229 aa  204  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 
214 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 
216 aa  201  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  56.41 
 
 
217 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  51.28 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 
214 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.67 
 
 
215 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 
211 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 
215 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
221 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  50.75 
 
 
224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  46.77 
 
 
226 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  42.36 
 
 
219 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  35.75 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.58 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
215 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
240 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
363 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  51.47 
 
 
235 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  47.44 
 
 
234 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
391 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.11 
 
 
356 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.1 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  42.22 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
440 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.05 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
401 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.14 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>