More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0245 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  88.64 
 
 		 220 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  53.05 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  41.78 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 411 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.47 
 
 		 369 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.35 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.35 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.35 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  38.32 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  32.03 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.37 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  36.75 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.56 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.54 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.55 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  31.64 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.58 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.27 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.56 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.91 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.91 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.75 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.61 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>