More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0508 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  79.43 
 
 		 214 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  56.22 
 
 		 209 aa  224  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  56.73 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  52.63 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  53.08 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  56.35 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55.9 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  58.21 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  57.87 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  54.27 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  56.94 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  57.79 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  57.36 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  52.02 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  58.88 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  55.67 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  58.97 
 
 		 202 aa  201  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  50.48 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  54.87 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  53.33 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  51.17 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  44.39 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  35.11 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.1 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  39.19 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.27 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.07 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  44.76 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  42.27 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  32.45 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>