174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1266 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 219 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  65.52 
 
 		 230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  39.91 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  40.55 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  41.78 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  40.09 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  41.4 
 
 		 258 aa  144  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  38.84 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  39.37 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  38.03 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  37.38 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.57 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  41.59 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  37.61 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  38.36 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  29.66 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  30.66 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 411 aa  55.1  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  27.85 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.33 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  27.8 
 
 		 383 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  28.18 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  28.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.54 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.67 
 
 		 356 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.8 
 
 		 378 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  26.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  27.73 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>