164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0500 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  64.62 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  64.5 
 
 		 212 aa  264  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  60.09 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  61.08 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  58.62 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  56.44 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  60.2 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  60.7 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  55.72 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  56.67 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  56.22 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  59.15 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 209 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  54.11 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  58.29 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58.38 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  55.38 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  56.25 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  55.17 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  52.11 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  54.67 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  57.07 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  55.77 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  53.47 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 		 202 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 		 202 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 		 202 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  50 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.68 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.45 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.16 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.95 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.63 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.12 
 
 		 356 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.3 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 412 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.5 
 
 		 442 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  31.82 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.13 
 
 		 383 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  31.82 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.63 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.45 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>