245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0571 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  70.73 
 
 
230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  64.62 
 
 
223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  64.5 
 
 
226 aa  264  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  59.72 
 
 
214 aa  257  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  60.4 
 
 
214 aa  254  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  59.15 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  64.56 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  56.25 
 
 
209 aa  244  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  59.91 
 
 
211 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  58.42 
 
 
216 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  59.5 
 
 
217 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  56.81 
 
 
211 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  58.91 
 
 
215 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  59.02 
 
 
217 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  59.62 
 
 
212 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  57.42 
 
 
258 aa  231  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
202 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
202 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
202 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  60 
 
 
218 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 
209 aa  227  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58.38 
 
 
208 aa  226  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  56.57 
 
 
208 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  56.85 
 
 
200 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 
211 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  56.72 
 
 
202 aa  221  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  57.28 
 
 
215 aa  216  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  52.83 
 
 
214 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.86 
 
 
214 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  54.98 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  57 
 
 
215 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  51.34 
 
 
226 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50.23 
 
 
221 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  50.48 
 
 
215 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  49.78 
 
 
224 aa  184  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.12 
 
 
230 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  36.57 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  48.75 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 
273 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 
369 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  45.78 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  50.6 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.24 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
363 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
402 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  37.36 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.15 
 
 
180 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  38.71 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.54 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.65 
 
 
356 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  44.58 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.93 
 
 
365 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.93 
 
 
365 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
389 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.93 
 
 
365 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  46.25 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
440 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 
261 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.57 
 
 
382 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.74 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>