186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4358 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  66.35 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.62 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.81 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  55.5 
 
 		 230 aa  230  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  51.18 
 
 		 209 aa  224  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  55.17 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  53.99 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  55.4 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  51.67 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  53.59 
 
 		 229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  51.89 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  54.03 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  54.84 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  54.23 
 
 		 217 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.55 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.25 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  51.98 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  51.78 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  53.3 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  56.44 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  50.45 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  49.76 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  52.48 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  51.49 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  51.27 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.07 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.05 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  44.16 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  38.55 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.58 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  24.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.43 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  40.26 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  46.77 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.67 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.15 
 
 		 356 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  23 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.77 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  45.68 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.01 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  38.03 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>