176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 
226 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  57.62 
 
 
214 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  60.09 
 
 
215 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  57.42 
 
 
212 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  59.72 
 
 
214 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.4 
 
 
214 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 
209 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  54.07 
 
 
211 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  58.79 
 
 
209 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  58.14 
 
 
218 aa  227  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 
202 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 
202 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 
202 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  57.08 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  56.73 
 
 
217 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  58.17 
 
 
212 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  57.43 
 
 
217 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  53.24 
 
 
230 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  56.87 
 
 
223 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  59.72 
 
 
211 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  56.78 
 
 
208 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  59.2 
 
 
211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  54.71 
 
 
226 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  60.41 
 
 
200 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  56.04 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  55.88 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  54.59 
 
 
221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  55.78 
 
 
229 aa  211  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  56.25 
 
 
215 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  59.3 
 
 
202 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 
211 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 
215 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 
214 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 
215 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  55.45 
 
 
224 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  41.4 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  38.57 
 
 
230 aa  141  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
219 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  37.12 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 
402 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.88 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.95 
 
 
369 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
190 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  34.31 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
411 aa  52.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.21 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
440 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  28.65 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.08 
 
 
356 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.54 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  48.33 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  41.56 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.39 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 
212 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
207 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
215 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
215 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
215 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
215 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
215 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>