More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6122 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  79.43 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  56.28 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  52.86 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 209 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  56.59 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  52.86 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  57.71 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  55.45 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  53.54 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  52.55 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  53.33 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  52.82 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  50.47 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  56.57 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  52.74 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  51.27 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  53.68 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.1 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  53.59 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  53.85 
 
 		 258 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  52.28 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  49.3 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  44.59 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  40.28 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  41.89 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  46.99 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  44.33 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  33.77 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 402 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.46 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.34 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  48.72 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.11 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.03 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  52.11 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  36.45 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  25.95 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.47 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.77 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.61 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.33 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>