178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0443 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  64.71 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  67.58 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  61.79 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  58.42 
 
 		 212 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  58.42 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  56.95 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  56.67 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  58.41 
 
 		 215 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  57.28 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  54.33 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  55.66 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  54.95 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  55.94 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  51.17 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  57.08 
 
 		 258 aa  215  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  55.45 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  55.66 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  59.8 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.4 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  57.29 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  56.8 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  56.22 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  57.28 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  56.78 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.98 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  55 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  54.23 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  54.27 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  52.45 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  53.43 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.12 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  37.16 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.31 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  30.46 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  43.53 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 363 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.26 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.83 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 		 411 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  43.53 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 402 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 412 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 427 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 		 383 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  30.63 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.86 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.75 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>