More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1035 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  78.74 
 
 		 209 aa  348  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  70.39 
 
 		 212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  68.45 
 
 		 209 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  67.35 
 
 		 202 aa  251  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  61.69 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  58.94 
 
 		 214 aa  247  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  57.87 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60.48 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  61.93 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  58.05 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  61.73 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 		 202 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 		 202 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 		 202 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  60.61 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.57 
 
 		 212 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  62.24 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  60.3 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  60.21 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  53.47 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  57.29 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.78 
 
 		 211 aa  214  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  55.88 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50.93 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  51.66 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  52.53 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.21 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  34.38 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  48.19 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.13 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.13 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.13 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.16 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.13 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  43.18 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  45 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  46.24 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.3 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  48.72 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25.38 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  39.8 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.72 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0041  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>