272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4099 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  94.69 
 
 		 218 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  66.82 
 
 		 215 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  61.31 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  59.5 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  57.42 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  60.28 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  64.97 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  64.97 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  64.97 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58.79 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  63.18 
 
 		 223 aa  247  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  62.94 
 
 		 200 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  54.11 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  61.73 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  61.73 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  57.6 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  59.6 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  55.39 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  59.6 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  56.52 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  57.28 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55.12 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  56.73 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  52.4 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  54.93 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  57.87 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.49 
 
 		 211 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  51.66 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  50.69 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.18 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  35.87 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.75 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.02 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.98 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.98 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.98 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.89 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  37.18 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.89 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.44 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  37.76 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.92 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  46.91 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  33.59 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.65 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  35.26 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.93 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  32.1 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>