199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0520 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  75.23 
 
 		 214 aa  339  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  68.81 
 
 		 218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  67.32 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  61.79 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  59.35 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  60.4 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  62.5 
 
 		 209 aa  251  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  63.9 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  61.08 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  57.46 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  61.01 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  64.18 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  60.7 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  57.82 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  54.46 
 
 		 211 aa  241  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  58.74 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 		 208 aa  235  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  57.01 
 
 		 215 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  59.72 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  58.49 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  58.13 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 217 aa  227  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  58.57 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  53.99 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  58.08 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  57.14 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  58.29 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  53.54 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  52.91 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  57.65 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  54.27 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.37 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  35.53 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.46 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.31 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.6 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.6 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.6 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  37.12 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.75 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 378 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  34.84 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.08 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  42.68 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  34.84 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  34.84 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  34.84 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  34.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 		 383 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.94 
 
 		 378 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 363 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>