More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3094 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.97 
 
 		 369 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.5 
 
 		 356 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  61.5 
 
 		 383 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  64.95 
 
 		 391 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.62 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.62 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.62 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  59.15 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.26 
 
 		 364 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  52.34 
 
 		 452 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.54 
 
 		 427 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.24 
 
 		 382 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  48.79 
 
 		 440 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 		 378 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.79 
 
 		 378 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.01 
 
 		 378 aa  167  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  47.71 
 
 		 402 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 		 412 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  40.29 
 
 		 411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  45.05 
 
 		 363 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 401 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 366 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 370 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.86 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 412 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.29 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.64 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.02 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.27 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.78 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.78 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.06 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.25 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.24 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.86 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.64 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>