More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2725 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  66.35 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  65.73 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  59.15 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60.37 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.28 
 
 		 214 aa  244  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  54.46 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  56.46 
 
 		 230 aa  237  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  56.35 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  56.22 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  56.52 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  54.07 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  51.23 
 
 		 209 aa  224  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  54.07 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  54.25 
 
 		 212 aa  221  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  53.17 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  53.12 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  57.22 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  53.05 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  51.17 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  50.23 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  51.23 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  54.98 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  51.89 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  52.79 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  50.75 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  52.02 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.36 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.78 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  46.75 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  48.78 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.43 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.63 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  47.56 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  43.59 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.33 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  43.21 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  30.07 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.68 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  28.67 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.05 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.05 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.05 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  41.03 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.75 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.15 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 391 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  43.94 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>