109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3293 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  75.66 
 
 
226 aa  349  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  60 
 
 
224 aa  254  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  58.3 
 
 
214 aa  245  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.74 
 
 
214 aa  238  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  56.95 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 
214 aa  228  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  54.42 
 
 
209 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  56 
 
 
218 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  52.65 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  53.49 
 
 
209 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  50.23 
 
 
211 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 
230 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  54.67 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  52.47 
 
 
215 aa  204  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  53.67 
 
 
258 aa  204  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  51.67 
 
 
208 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  53.05 
 
 
212 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
211 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  53.05 
 
 
217 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  53.3 
 
 
202 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  53.24 
 
 
215 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  52.51 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  50.7 
 
 
229 aa  194  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  51.82 
 
 
223 aa  194  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  50.23 
 
 
212 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  50.93 
 
 
208 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 
217 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  49.54 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  48.33 
 
 
211 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  48.24 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  44.59 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.84 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.48 
 
 
230 aa  121  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 
383 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.33 
 
 
229 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.22 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.22 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.22 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  28.65 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.25 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
274 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.91 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
171 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.63 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
223 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.35 
 
 
356 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  27.27 
 
 
340 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  28.4 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3664  Phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.753638  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  29.38 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  27 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
421 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  32.39 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  26.02 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>