189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5262 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
421 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  45.74 
 
 
443 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  50.53 
 
 
584 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  47.86 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 
259 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 
231 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 
231 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  46.04 
 
 
236 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 
224 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 
224 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
223 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  36.23 
 
 
224 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  36.49 
 
 
202 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
211 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  43.53 
 
 
215 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
212 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
223 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
225 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
195 aa  57.4  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
220 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
232 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
215 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
208 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35517  predicted protein  37.04 
 
 
220 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0923281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 
209 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
206 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
215 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
215 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
215 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34 
 
 
213 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
223 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.5 
 
 
227 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
243 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 
216 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 
183 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  26.6 
 
 
229 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.66 
 
 
427 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  25.32 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
221 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
221 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
210 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
192 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
389 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
209 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
220 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
223 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
226 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.01 
 
 
214 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
212 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
226 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
221 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  30.56 
 
 
212 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 
216 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
217 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
253 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.32 
 
 
233 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
227 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  34.26 
 
 
208 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 
217 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.43 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
194 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
213 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.43 
 
 
203 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  34.41 
 
 
235 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
215 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.99 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.99 
 
 
203 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.99 
 
 
203 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  25.99 
 
 
203 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  33.9 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
224 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
205 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  25.99 
 
 
203 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>