134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3655 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
374 aa  731    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  49.13 
 
 
421 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  38.48 
 
 
443 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  43.8 
 
 
584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  38.76 
 
 
236 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 
231 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 
231 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 
224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
224 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 
223 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  33.01 
 
 
224 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
238 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  30.14 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 
218 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
208 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
232 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
226 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 
207 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
215 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
215 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
200 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
225 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
214 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 
205 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
220 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
192 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
241 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0041  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
197 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.72 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
224 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 
203 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
228 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
214 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.11 
 
 
213 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
216 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
205 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 
183 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
216 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
214 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 
229 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  33.93 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
223 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.95 
 
 
427 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.06 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
223 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
204 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
200 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
220 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 
200 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
226 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  25.7 
 
 
193 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.8 
 
 
443 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
226 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.12 
 
 
200 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.12 
 
 
200 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 
223 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.12 
 
 
200 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
223 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  25.76 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
181 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
203 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>