225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0219 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  48.46 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  47.16 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  49.06 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  48.1 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  42.33 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  37.5 
 
 		 202 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  34.26 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  30.77 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.25 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.25 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  34.84 
 
 		 584 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  34.29 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.81 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  34.53 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  34.29 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  34.53 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.53 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  34.53 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  34.53 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  47.13 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.47 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  33.81 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  43.43 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.38 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  42.53 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.38 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.38 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.34 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.12 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.54 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.47 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.47 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  32.73 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.47 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>