More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4034 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  78.28 
 
 
224 aa  348  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  47.6 
 
 
238 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 
224 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  46.38 
 
 
203 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  44.25 
 
 
224 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  43 
 
 
202 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
225 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
259 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
231 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
231 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
443 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 
211 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
421 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
232 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  31.03 
 
 
236 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  37.72 
 
 
584 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
228 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
228 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
228 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
374 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.22 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.85 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  36 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.08 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
440 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.12 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.12 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.12 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.57 
 
 
382 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
230 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  28.99 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.75 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
591 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
188 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.83 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.36 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>