31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08861 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  349  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  34.42 
 
 
164 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.88 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
205 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
205 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
205 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
205 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  28.48 
 
 
197 aa  58.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  25.17 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  25.17 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  30.09 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  26.62 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
223 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  38.03 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  36.62 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  24.85 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.149993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
421 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
374 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 
193 aa  40.8  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  30.56 
 
 
224 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>