242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1875 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
193 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1754  phosphoglycerate mutase family protein  37.02 
 
 
189 aa  144  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0783  phosphoglycerate mutase family protein  37.43 
 
 
177 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  30.27 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  27.57 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1619  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.958559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.11 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.65 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1795  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  32 
 
 
246 aa  89  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3758  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.02 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000119395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3591  phosphoglycerate mutase family protein  27.47 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3876  phosphoglycerate mutase family protein  27.47 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3491  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3503  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0158096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3778  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.47 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.229093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1453  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.92 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.75 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3514  phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0342189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
223 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3845  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.92 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4837  phosphoglycerate mutase family protein  29.31 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5203  phosphoglycerate mutase family protein  29.31 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5074  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.31 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5107  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.89 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4680  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
220 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4696  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.39 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5112  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.74 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.69 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0126  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.16 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023216  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
245 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.49 
 
 
229 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5114  putative phosphoglycerate mutase family protein  27.59 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0497299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4794  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  26.42 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
241 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 
228 aa  57.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  28.05 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.25 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  28.05 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  28.05 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>