More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1435 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  43.01 
 
 
193 aa  166  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  41.3 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  41.85 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  42.27 
 
 
191 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  42.47 
 
 
191 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  42.47 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1754  phosphoglycerate mutase family protein  38.6 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 
191 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  39.38 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  39.46 
 
 
191 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  39.46 
 
 
191 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  42.16 
 
 
191 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1795  phosphoglycerate mutase family protein  38.92 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1619  phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.958559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3514  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
203 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0342189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 
205 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3758  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.69 
 
 
191 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000119395 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  32.57 
 
 
246 aa  101  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3778  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.55 
 
 
191 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.229093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1453  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.02 
 
 
191 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204628 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3491  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0783  phosphoglycerate mutase family protein  33.52 
 
 
177 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3591  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3876  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3845  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3503  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0158096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5114  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.38 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0497299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0126  putative phosphoglycerate mutase family protein  27.42 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4794  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5107  phosphoglycerate mutase family protein, putative  26.99 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5074  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.99 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4837  phosphoglycerate mutase family protein  26.99 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4696  phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5203  phosphoglycerate mutase family protein  26.99 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4680  phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5112  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.38 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000628786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.04 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  29.76 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.94 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  25.61 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  24.54 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  24.54 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
215 aa  61.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  24.39 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  30.52 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.22 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.09 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.22 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  28.81 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  23.78 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  24.72 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3761  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  25.47 
 
 
203 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  26.49 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>