71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4770 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  31.68 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.85 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  32.21 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  33.78 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  39.37 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.96 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  28.47 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 199 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  40.58 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  29.22 
 
 		 385 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 440 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 209 aa  47.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.97 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.97 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.97 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  28.97 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.3 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.09 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  29.49 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  29.49 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  23.62 
 
 		 159 aa  42  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 240 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 214 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  36.76 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  36.76 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 374 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.74 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.88 
 
 		 308 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 443 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.35 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.73 
 
 		 203 aa  40.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  36.76 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>