27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3822 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  96.1 
 
 
205 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  96.59 
 
 
205 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  94.15 
 
 
205 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  73.1 
 
 
197 aa  258  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  65.85 
 
 
201 aa  255  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  73.62 
 
 
197 aa  247  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  73.01 
 
 
197 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  73.01 
 
 
197 aa  244  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  51.7 
 
 
181 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 
178 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  45.39 
 
 
179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
168 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.88 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  29.09 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  28.05 
 
 
167 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2914  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  28.87 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
202 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
203 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>