26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4259 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.67 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  39.84 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  38.4 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  39.37 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  34.13 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  29.92 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>