28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0749 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  78.28 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  76.65 
 
 		 197 aa  284  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  77.78 
 
 		 197 aa  283  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  73.1 
 
 		 205 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  66.84 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  66.33 
 
 		 205 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  66.32 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  73.89 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  46.63 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  47.78 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  30.82 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.37 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.97 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  28.48 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2914  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  25.31 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  23.7 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  28.17 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 203 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>