35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3093 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  84.05 
 
 		 232 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  53.04 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.4 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.45 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.3 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.67 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.86 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  37.4 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  37.4 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  37.4 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  37.4 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  28.29 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  32.3 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  36.28 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  36.28 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  34.51 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  23.76 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  23.81 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  23.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  31.08 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  33.7 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  23.7 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  30.33 
 
 		 203 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  30.33 
 
 		 203 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  30.33 
 
 		 203 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>