27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2374 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 229 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  75.11 
 
 		 229 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.44 
 
 		 172 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.67 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.62 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  44.57 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  37.33 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  30.07 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  35.09 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  35.09 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  35.09 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  35.09 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  35.09 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  33.33 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  33.33 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  33.33 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  33.33 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  33.33 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  25.36 
 
 		 166 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>