24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3393 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  98.5 
 
 
200 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  99 
 
 
200 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  98.5 
 
 
200 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  98.5 
 
 
200 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  98 
 
 
200 aa  406  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  98 
 
 
200 aa  406  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  97 
 
 
200 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  68.34 
 
 
201 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  67.34 
 
 
201 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  66.83 
 
 
201 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  66.83 
 
 
201 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  66.33 
 
 
201 aa  277  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  40.62 
 
 
194 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.05 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.65 
 
 
228 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.65 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.04 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.65 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.06 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  33.33 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.21 
 
 
229 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  33.03 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  34.51 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>