29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4776 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  89.91 
 
 		 228 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.48 
 
 		 172 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  44.59 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.23 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  41.89 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.43 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  33.11 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  34.01 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  34.01 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  34.01 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  34.01 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  34.01 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  32.65 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  35.45 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  31.68 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.84 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.09 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.92 
 
 		 161 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>