31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5583 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  100 
 
 		 228 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  53.04 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  58.29 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.37 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.59 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  55.21 
 
 		 172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.71 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.68 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  27.15 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  33.33 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  34.21 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  23.74 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  28.17 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>