25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2560 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  75.11 
 
 		 229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.72 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.23 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  55.23 
 
 		 172 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  39.72 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  36.92 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  31.52 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  37.17 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  38.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  38.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  38.05 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  38.05 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  34.21 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  34.21 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  36.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>