27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2834 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  39.41 
 
 
231 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  40.21 
 
 
228 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  42.37 
 
 
232 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.62 
 
 
228 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.54 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.74 
 
 
223 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.77 
 
 
172 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.04 
 
 
229 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.04 
 
 
229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  35.11 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  32.95 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  32.95 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  32.95 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  32.95 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  35.65 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  33.61 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  34.19 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  34.19 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  30.46 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1421  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.49 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1672  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.07 
 
 
220 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.772188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>