25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4638 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  89.91 
 
 		 228 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.48 
 
 		 172 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  46.4 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  47.37 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  43.66 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.72 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.16 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  34.29 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  32.65 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  32.65 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  32.65 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  32.65 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  32.65 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  32.65 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  38.46 
 
 		 157 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>