25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0729 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  34.65 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  34.65 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  35.5 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  42.77 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.11 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.61 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.57 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  28.4 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  33.91 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  35.34 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  35.34 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  33.04 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  33.04 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  30.43 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  30.43 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  30.43 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  30.43 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  30.43 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3811  hypothetical protein  27.97 
 
 		 200 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>