25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2981 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 172 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.48 
 
 		 228 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.48 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  55.23 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  55.21 
 
 		 228 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  54.44 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  50.3 
 
 		 231 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  47.85 
 
 		 232 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 223 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 217 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  36.03 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  36.73 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  37.41 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  36.73 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  36.73 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  36.73 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  36.73 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  36.73 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  36.73 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  36.05 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  36.05 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  27.39 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>