24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0842 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  47.78 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  47.85 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  46.45 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  49.39 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  43.58 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  47.65 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  46.98 
 
 		 205 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  41.78 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.62 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.81 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  33.02 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  27.78 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>