115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0187 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  43.82 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.37 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  36.13 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.45 
 
 		 175 aa  87.8  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  32.75 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  34.88 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  43.42 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  43.42 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  41.86 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  41.86 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  40.7 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  41.77 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.8 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.84 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  41.03 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.47 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 220 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  30.5 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.06 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 591 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.59 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.59 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.95 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.14 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  31.76 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 288 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 220 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 208 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 452 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  29.58 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>