27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0856 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 178 aa  355  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  47.4 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  48.17 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  48.17 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  51.53 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  50.59 
 
 		 197 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  53.29 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  49.34 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  44.13 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  47.92 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.73 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  38.4 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  33.08 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2914  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>