31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0941 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  54.3 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  51.7 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  51.7 
 
 		 205 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  51.7 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  46.63 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 205 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  50.34 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  49.66 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  49.66 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 		 197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  44.13 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.33 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  32.82 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.51 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  30.09 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  31.88 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 440 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  25.71 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>