23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3232 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
201 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  65.85 
 
 
205 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  64.88 
 
 
205 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  65.85 
 
 
205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  64.39 
 
 
205 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  71.18 
 
 
197 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  73.89 
 
 
197 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  73.89 
 
 
197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  73.55 
 
 
197 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  47.46 
 
 
181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  46.95 
 
 
178 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  48.54 
 
 
197 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  45.89 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
179 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  32.84 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.05 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  27.04 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  27.14 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2914  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 
212 aa  42  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>