43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0333 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  337  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  42.62 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.23 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  34.42 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  40.16 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.17 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  30.82 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  32.82 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  32.35 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 224 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  26.56 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 200 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 193 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.43 
 
 		 213 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 402 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 191 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>