25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3352 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  99.49 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  92.89 
 
 		 197 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  78.28 
 
 		 197 aa  304  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  72.51 
 
 		 205 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  70.95 
 
 		 205 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  70.39 
 
 		 205 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  70.17 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  73.89 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  46.37 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  49.7 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  47.49 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  31.88 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.07 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  24.87 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  23.78 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  28.35 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>