24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3107 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  34.23 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  39.84 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  43.31 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  33.97 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  34.96 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.95 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 220 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>