184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0942 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
170 aa  325  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.98 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.5 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.87 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.74 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.27 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.06 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.27 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.12 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
149 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.85 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.15 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.42 
 
 
154 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.94 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.54 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  37.6 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.6 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.35 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  37.31 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  37.31 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.85 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  34.62 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.65 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  28.26 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.8 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  40.83 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.41 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.55 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  37.59 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.6 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  36.57 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  36.57 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  36.57 
 
 
153 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  36.57 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.44 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.57 
 
 
164 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
315 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.08 
 
 
156 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.33 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
299 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.19 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
333 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  36.42 
 
 
157 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  35.34 
 
 
216 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
157 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.15 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  31.29 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
314 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
311 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
311 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
311 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  36.8 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.2 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.69 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
310 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  25.98 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.21 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.21 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.53 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  36 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  32.28 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.51 
 
 
325 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.69 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.37 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  32.3 
 
 
462 aa  48.5  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.41 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.6 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.64 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.84 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.74 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.09 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>