180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1087 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  54.3 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  59.33 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  58 
 
 		 216 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.33 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  57.33 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  53.8 
 
 		 157 aa  156  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  57.24 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  53.21 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  56.67 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  56 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  56.67 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.98 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  56.67 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  56 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  55.92 
 
 		 218 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.56 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.03 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  56 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  51.59 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.78 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  55.06 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  52.87 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  56.21 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.27 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  51.63 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  52.94 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  49.31 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  56.67 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.66 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  50 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  50.33 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.22 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  38.4 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.59 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.76 
 
 		 174 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  35.71 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.57 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.21 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.15 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  35.2 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.69 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.33 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  32.54 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.92 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.12 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.3 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.67 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  38.64 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  36.07 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  34.88 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  34.15 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  33.6 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.31 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.62 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.41 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.66 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.68 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  30.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.05 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.1 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>