167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2162 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  80.13 
 
 		 156 aa  264  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  78.85 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  79.49 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  75.64 
 
 		 170 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  72.44 
 
 		 156 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  69.87 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  62.58 
 
 		 157 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  64.47 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  42.31 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  41.25 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.55 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  37.42 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  39.87 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  37.82 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  40.29 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  39.49 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  40.51 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.21 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  44.37 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  44.37 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.75 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  43.8 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  36.94 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  34.25 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  36.55 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  36.29 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.3 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  34.68 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.37 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.81 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  36.29 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.56 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.1 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  35.48 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.56 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.59 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.94 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.39 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.65 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.45 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.58 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.67 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.42 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  30.99 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  30.99 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  32.52 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.85 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.53 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  31.82 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.37 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.31 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.35 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  33.06 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.02 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.66 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  32 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.5 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.85 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  34.45 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.89 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.28 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.5 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>