192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2131 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
159 aa  307  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  89.31 
 
 
159 aa  283  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.72 
 
 
168 aa  111  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.91 
 
 
169 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.04 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.51 
 
 
169 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 
168 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.21 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.41 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.49 
 
 
161 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.35 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.18 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.16 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.61 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.77 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.29 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  38.18 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  38.41 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.93 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.37 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.55 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.2 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  40 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.25 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.11 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.68 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4928  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.65 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.64 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.6 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  29.53 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.64 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.27 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  36.49 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.03 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.71 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.25 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.3 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2247  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.14 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  32.7 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.7 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  29.19 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  29.19 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  29.19 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  29.19 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.09 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.78 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2932  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.42 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  30.25 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.17 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.41 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.68 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  38.52 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  29.38 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  37.78 
 
 
216 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.94 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.23 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1087  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.69 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.321142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  28.3 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  30.43 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  31.79 
 
 
462 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.76 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.39 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.5 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.5 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  31.62 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.04 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.53 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.53 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  34.96 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  30.63 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.96 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.8 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.04 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  31.19 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.13 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.22 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>