162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002860 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 		 154 aa  321  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  88.31 
 
 		 154 aa  288  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  69.03 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  50 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.29 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  40.65 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  43.36 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  46.1 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.88 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.88 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.25 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.25 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.25 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.25 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.88 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.88 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.94 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.91 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.66 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.29 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  40 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  39.35 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  37.82 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  41.61 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  38.71 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  35.37 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  39.33 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  37.42 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  36.36 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  35.34 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.66 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  37.76 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  39.5 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.4 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.03 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.71 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.11 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.54 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  32.8 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.79 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  35.25 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.41 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  29.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.64 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.79 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.83 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  25.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  25.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  25.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  25.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.48 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.83 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.45 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  25.17 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  25.17 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.04 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.59 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  30.25 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  27.59 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.69 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.91 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  30.2 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1257  phosphohistidine phosphatase, SixA  23.42 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.204304  normal  0.125105 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  26.9 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.72 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>